Martin de la Pramac Racing conduce campionatul cu 366 de puncte, în timp ce Bagnaia de la Ducati are 345. Marquez este al patrulea, la 78 de puncte în spatele lui Martin, după ce s-a retras din Marele Premiu al Indoneziei din cauza unor probleme la motor într-o poziție care aducea puncte.
Marquez a mai spus că Enea Bastianini - care se află la trei puncte în fața sa, pe locul trei - este, de asemenea, probabil în afara cursei pentru titlu după ce a căzut la câteva secunde după ce a stabilit cel mai rapid tur în Mandalika.
"Aveam deja un deficit mare, iar după scorul de zero puncte din Marele Premiu al Indoneziei, diferența este acum prea mare", a declarat Marquez reporterilor înainte de Marele Premiu al Japoniei din acest weekend.
"Titlul a fost ținta noastră în ultimele cinci curse, dar se pare că acum campionatul este game over pentru noi. Diferența este deja prea mare, iar titlul este o cursă între doi oameni.
"Acest lucru îmi oferă liniștea de a continua să lucrez la punctele slabe din ultimele curse și să le confirm pe cele puternice."
Marquez este singurul dintre primii patru piloți care conduce Ducati Desmosedici GP23 de anul trecut, ceilalți trei pilotând cele mai noi GP24.
Dar spaniolul, care se va muta la echipa de uzină Ducati anul viitor, s-a obișnuit încet cu notorul după ce a făcut trecerea de la Honda înainte de sezonul 2024.
După o serie de podiumuri, Marquez a câștigat în cele din urmă prima sa cursă în 1 043 de zile, când a luat steagul roșu la Marele Premiu de la Aragon și a urmat cu o altă victorie în San Marino.
Dar cu cinci curse rămase în sezon, Marquez a declarat că se va concentra acum pe îmbunătățirea timpilor săi de calificare după ce a căzut în Q2 în marile premii recente.
"Voi încerca, așa cum am spus înainte de Mandalika și Misano, să termin sezonul într-un mod bun, încercând să găsesc acea consistență...", a spus el.
"Să vedem dacă putem lupta pentru podium".